Дон Эстебан - необходимо выполнить линейку квестов за Дона в Харбор-Тауне и получить задание "Пакет для Дона". После передачи пакета вы присоединитесь к фракции Дона Эстебана.
Маги - в Харбор-Тауне необходимо выполнить линейку квестов за Орден для Коменданта Карлоса и задания мага Белшвура. После этого можно будет пойти в монастырь, где предложат выбор кем быть - магом или воином Ордена.
Орден (Инквизиция) - помимо вышеописанного способа, можно просто дать возможность инквизиции поймать вас вне города для насильного рекрутирования.

Если сообщить Игнатию, что у Палласа для вас нет заданий, когда еще не закрыт квест с убийством послушника и Паллас не сказал "ты и так много сделал для монастыря, я не буду тебя испытывать", ответ будет таким - "имей терпение, он еще даст задание". После этого даже если поговорить с Палласом, повторно сообщить Игнатию об отсутствии задания невозможно, и квест становится невыполнимым. Решение - переиграйте и сообщите Игнатию о прохождении всех испытаний в самом конце, когда уже переговорите в обязательном порядке со всеми магами и сдадите все второстепенные квесты, и главное - когда Паллас скажет необходимую фразу.

1. В сундуке (островок посреди болота)
2. Луис (островок в восточной части болота)
3. Дорган (пещера на юго-востоке болота)
4. Крейг
5. Брогар
Обломки можно отобрать силой, выкупить/выменять или украсть.

Если внимательно слушать или читать, то узнаем, что он в секретной комнате под библиотекой. Идем в библиотеку, там есть кольцо за которое можно дернуть, потом исследуем подземелье - там куча книг с мудростью, в конце комната которая открывается дерганьем за кольцо, там скелет. Почти в начале подземелья есть закрытая дверь, идем в одну из комнат в конце к Кристальному Шару Открытия. Берем заклинание открытия, бежим к той двери, открываем ее заклинанием. Дальше, в одной из комнат есть Кристальный Шар Наутилуса. Попасть туда можно или при помощи Шара Левитации из комнаты напротив, и пройдя через маленькое отверстие (если есть свиток наутилуса, можно пропустить комнату с шаром), превращаемся в наутилуса, ползем к той комнате, что открыли, проползаем в маленькое отверстие за ящиком и попадаем к мастеру Абраксу

За Дона/За Орден - указано, кто дает и после какого квеста происходит изменение отношений.
1. Дельгадо (Плата за защиту от Косты)/Себастьян (Притворная работа на Дельгадо)
2. Сид (Дойл должен исчезнуть)/Родригес (Избавься от Сида)
3. Хорек (Принеси пакеты назад к Хорьку)/Марчело (Доказательство для Марчело)
4. Тони (Семейная реликвия)/Эрнандес (Отнеси фамильную драгоценность Дона Эрнандеса)
5. Лукор (Лукору нужны доспешные пластины)/Караско (Караско нужны доспешные пластины)
6. Романов (Морской сундук Романова)/Серджио (Серджио хочет золото Романова)
7. Скордо (Три золотые чаши для Скордо)/Караско (Бог любит троицу)
Всего "двойных" заданий семь. Для присоединения к одной из сторон необходимо выполнить минимум четыре задания для нее.

Можно посмотреть на карте. Но если не хочется, то вот примерное расположение
1. На западном побережье (чуть не доходя до руин со скелетами)
2. На островке южнее Харбор-Тауна
3. Возле хижины Леона
4. На уступе над фермой Тристана (прыгать сверху)
5. Неподалеку от западных ворот в Харбор-Таун

За вторыми руинами (башней) на западном побережье.

В первых (больших) руинах на западном побережье. Дверь камеры выходит на море.

1. В одном из саркофагов
2. Даст Ольф за свое спасение (Ольф в камере в глубине храма).
3. Даст Дирк за свое спасение (Дирк в ловушке в самой первой комнате).

Нужно подойти к барьеру, нажать левую кнопку мыши и послушать комментарии героя, а потом отправляться с этой проблемой к магу Сайрусу.